L’objectif était d’étudier les effets de l’exposition à la température ambiante sur les métabolites microbiens provenant d’échantillons fécaux félins.
Le métabolome fécal apporte des informations sur la santé gastro-intestinale et microbienne. Les méthodes de conservation des échantillons fécaux sont variables dans la science métabolomique, ce qui rend difficiles les comparaisons dans la littérature actuelle. Cette étude à explorer les effets de l’exposition à la température ambiante de métabolites microbiens provenant d’échantillons fécaux félins.
Des échantillons fécaux provenant de 11 chats sains ont été prélevés au sein d’une pension pour chats. Les échantillons ont été homogénéisés et répartis en partie aliquotes à la main. La première partie aliquote a été congelée à -80 °C dans l’heure suivant la défécation, les échantillons restants ont été exposés à la température ambiante pendant une durée de 2, 4, 6, 8, 12 et 24 heures avant d’être eux aussi congelés à -80 °C. Les métabolites fécaux ont été quantifiés à l’aide d’une spectroscopie à résonance magnétique nucléaire 1H. Cinquante (50) métabolites ont été regroupés en six catégories (27 acides aminés, 8 acides gras, 5 sucres, 3 alcools, 2 bases azotées, 5 divers).
Les résultats ont montré que les concentrations de 20 échantillons sur 50 avaient été significativement altérées à cause de leur exposition à la température ambiante (7 acides aminés, 6 acides gras, 2 alcools, 1 base azotée, 4 divers). Les changements détectés les plus précocement sont survenus 6 heures après la défécation, et concernaient la cadavérine et l’acide fumarique.
En conclusion, cette étude démontre qu’une exposition à la température ambiante altère la composition du métabolome fécal félin, mais qu’une exposition courte (jusqu’à 4 h) avant le stockage dans un congélateur semble être acceptable.
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